Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms