Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms