Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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