Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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