Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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