Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COX10Q12887 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COX10Q12887 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms