Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms