Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms