Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms