Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms