Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms