Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms