Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDKL1Q00532 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms