Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX1P83916 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms