Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms