Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBEYP58557 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBEYP58557 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBEYP58557 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBEYP58557 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBEYP58557 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
YBEYP58557 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBEYP58557 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBEYP58557 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBEYP58557 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YBEYP58557 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms