Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN8P56748 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms