Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIM2P55344 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIM2P55344 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms