Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms