Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT8P50990 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms