Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARRB1P49407 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms