Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms