Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms