Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms