Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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