Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms