Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADLP28330 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACADLP28330 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADLP28330 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADLP28330 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADLP28330 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADLP28330 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADLP28330 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADLP28330 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADLP28330 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADLP28330 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms