Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms