Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMA3P25788 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms