Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMA1P25391 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms