Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALB2P22676 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALB2P22676 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms