Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMD1P17707 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMD1P17707 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMD1P17707 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms