Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB1P16220 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB1P16220 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms