Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC130P13994 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms