Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms