Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms