Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms