Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD2P0DJD1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms