Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF888P0CJ79 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms