Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAPGEF3O95398 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAPGEF3O95398 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAPGEF3O95398 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAPGEF3O95398 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAPGEF3O95398 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAPGEF3O95398 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms