Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F6O75461 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F6O75461 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms