Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN2BO60939 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN2BO60939 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms