Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms