Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms