Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NACAE9PAV3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms