Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms