Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
B4DXG7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
B4DXG7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
B4DXG7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms