Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms