Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms