Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB5A4FU69 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB5A4FU69 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB5A4FU69 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB5A4FU69 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB5A4FU69 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms